En realidad no es un bloqueo de region, aunque funciona como tal, la bios de la master eu/usa hace una comprobación de crc para ver si está el cartucho bien metido, para eso hay un código grabado en la rom que le dice a la bios cuál tiene que ser el resultado, ese código no está en los cartuchos japoneses y por eso no arrancan. La bios jap no hace esa comprobación.
El bloqueo más bien era físico, los cartuchos tienen formas distintas, claro que con las tarjetas eso no pasa.