The Legend of Zelda: Wind Waker HD es un remake en alta definición del clásico para GameCube. Además de mejores gráficos, esta edición del título para Wii U ofrece nuevas características. La pantalla táctil del GamePad sirve como inventario y para utilizar algunos objetos, ofrece una carga del océano más rápida, posibilidad de mejorar la velocidad del barco y la sustitución de la compatibilidad con Game Boy Advance por el Tingle Botella, lo cual permite compartir mensajes y fotografías mediante Miiverse.
Además de la edición estándar, The Legend of Zelda: Wind Waker HD se podrá adquirir en una edición limitada que incluye una figura de Ganondorf blandiendo dos espadas; y otra junto a una Wii U Premium, que incluye un GamePad decorado con inscripciones doradas, un blasón dorado de Hyrule y los símbolos dorados del juego.