Mientras que el primer Mega Man Legacy Collection presentaba los seis primeros juegos de la saga, Mega Man Legacy Collection 2 incluye los siguientes cuatro títulos: Mega Man 7, Mega Man 8, Mega Man 9 y Mega Man 10.
- Mega Man 7: Un clásico de los 16 bits que añade una tienda de power-ups dentro del juego y presenta al misterioso Bass acompañado por Treble. Disponible para Super Nintendo desde 1995.
- Mega Man 8: El paso a los 32 bits y por primera vez con animaciones y voces para las escenas. Originalmente publicado en Japón para PlayStation en 1997.
- Mega Man 9: Regreso a las raíces con gráficos, música y jugabilidad de 8 bits. Desarrollado para Wii, PlayStation 3 y Xbox 360 y publicado en 2008 mediante sus tiendas digitales. Incluye todo el contenido adicional.
- Mega Man 10: Conserva las características de su antecesor y presenta tres personajes jugables: Mega Man, Proto Man, y Bass. De nuevo desarrollado para Wii, PlayStation 3 y Xbox 360 y publicado en formato digital en 2010. Incluye todo el contenido adicional.
Mega Man Legacy Collection 2 también añade Mega Man Museum con un archivo histórico que incluye materiales de desarrollo y un modo de juego “friendly” diseñado para los jugadores primerizos, que presenta puntos de guardado extra y una mayor capacidad de supervivencia para Mega Man. Al igual que la anterior entrega también presenta un modo de juego que permite jugar con los niveles mezclados y tablas de clasificación en línea.