El GTA que yo sepa es el único que no hay que instalar todo, ya que sí no instalas el segundo disco, las cargas se hacen a la vez desde el DVD y desde el HDD, y al cargar en paralelo, va mas rapido, y tienes menos popping.
El resto de juegos creo que no son capaces de leer de 2 sitios a la vez.
En el GTA sólo conviene instalar en el HDD la parte obligatoria. El otro disco, si quieres, puedes instalarlo en un buen pendrive USB, así tienes menos popping, pero sin el ruido del DVD.