La misión Mareas Negras "cierra la historia de Yasuke y Naoe", dice Ubisoft. En este nuevo y último capítulo los dos protagonistas se enfrentan a un par de templarios de élite conocidos como la Cruz Negra que han llegado a Japón para darles caza por los problemas que han causado, "pero quizás tengan sus propios objetivos", añade el equipo de desarrollo. Para acceder a esta misión es necesario haber terminado las historias principales de Naoe y Yasuke, además de completar las dos entregas de historias anteriores incluyendo Un encuentro crítico, en la que se recluta a Rufino, y Desconcertante, en la que se hace lo propio con Kane y Kinu.
No hace falta completar Las garras de Awaji para acceder a Mareas Negras.
Por otro lado tenemos los Dominios, una nueva actividad dirigida a los jugadores que quieran aprovechar el equipo que han obtenido en un contenido "de gran dificultad". "Los Dominios son una actividad del Animus que pondrá a prueba tu habilidad para el diseño de personajes de rol cuando abordes sus cinco nuevos escenarios de juego con sus diez niveles de dificultad", dice Simon Lemay-Comtois, director asociado de Assassin's Creed Shadows. "Cuanto mayor sea la dificultad más modificadores de mecánicas se aplicarán". El objetivo es poner en aprietos a los jugadores para que adapten sus estrategias.
Dominios tiene su propio mercader y moneda de juego que sirve para comprar nuevos conjuntos de equipo, nuevos grabados y nuevas armas. Además, esta actividad cuenta con un árbol de progreso en el que se pueden obtener trucos del Animus. Algunas de las recompensas que se consiguen en los Dominios son especiales y nunca estarán disponibles en la tienda ni en Intercambio. Además, tenemos dos nuevos proyectos (Riptides y Undertow) para el Animus Hub con recompensas que unen el Japón feudal con el Caribe. Estos dos proyectos también serán jugables en Assassin's Creed Black Flag Resynced.
En las notas del parche 1.1.11 para Assassin’s Creed Shadows también figuran un buen número de errores solucionados y mejoras en el rendimiento para Switch 2 en modo portátil.