Hola,
Pues yo desde mi experiencia, tengo un MSI GE60 que compré hace unos años y la verdad estoy encantado. Ambas marcas que comentas son de las mejores para PC. Yo te recomendaría que a igualdad de prestaciones te decantes por el que más te convezca a nivel visual, colores, etc.
Como te digo, yo tengo un MSI y lo recomendaría 100%, pero el ASUS no tiene que ser nada malo tampoco, es un poco cuestión de gustos, manías, etc.
También destacar que el asus tiene pantalla TFT-LCD mientras que el MSI tiene IPS. El teclado del MSI está diseñado por SteelSeries y me da la sensación de tener mejor pinta. Yo me decantaría por el MSI, pero como te digo, también es un poco cuestión de gustos.