Es informática tio, es inexplicable.. jej
El mio, con la anterior placa que tenía, se encendía solo al llevar justo 24h apagado, todo el ordenador, como si le dieses al botón de encendido... revisé mil cosas pero no di con la clave, lo último que leí es que algunas placas asrock hacían ésto de forma inexplicable... ahora tengo otra asrock y no me ocurre eso.
De cualquier modo, lo tuyo parece claro que es por eso, porque los usb permanecen encendidos, en bios hay opción de cambiar eso, y también te diría que no son todos. Yo cargo el movil en el pc (apagado), sin embargo leds de teclado y ratón permanecen apagados.