Hombre, lo mejor es probar antes de reinstalar. Ahorras muchísimo tiempo, no estamos hablando de instalar unos drivers de la gráfica, es todo el SO y programas.
Que te va mal, entonces sí, instalas de cero. En mi caso y por experiencia propia, nunca he tenido un sólo problema de algún tipo cambiando placas base sin formatear HDD. Ni con activaciones de Windows, ni drivers, ni ná de ná.
Tú mismo.