Que no te deja guardar en ningún formato o sólo en pdf?
En la impresora te aparece opción 'escanear al equipo X' ?
No se como van las brother, pero hay dos tipos de configuración. Por software, que tú en ordenador X instalas el software de la impresora y ese ordenador aparece en la impresora para escanear. Opción dos, crear y compartir la carpeta en un ordenador, dando permisos lectura/escritura para todos. Luego añadir esa carpeta en la impresora, te piden la ruta, usuario y contraseña que hay en ese ordenador.
Prueba a configurar en otro ordenador.
La carpeta compartida crea en la raiz de C:\ .
Si tiene garantilla, llama al fabricante, tendrás la respuesta como configurar correcta mente en dos minutos.
Saludos.