Yo opino que las rascadas son por el micro, quizá en accesos a memoria, por el pci-e 1.1 puedes perder un par de frames apenas (por ejemplo), vamos que no es significativo.
En si no es un cuello realmente importante, está más o menos equilibrado pero el micro habría que subirlo algo más y las ram a 1066 a ver si mejorase el tema de las rascadas, primero monitoriza con el monitor de recursos y msiafterburner el cpu, ram, hdd y gpu, a ver cual es el que se satura, y revisa voltajes y temperaturas con aida64.