puede que tu placa madre no lo acepta a más que solo lo pueden utilizar los últimos processadores de Intel Ivy Bridge, aunque nunca se va a llegar a las cantidades máximas de PCIE 3.0 ni tampoco vas a notar mucha diferiencia entre PCIE 2.0 y 1.1.
Pasa el modelo de la placa y el processador si a caso.
Saludos