Si únicamente eliminas la partición (o particiones) de Ubuntu, te quedarás sin poder arrancar Windows. Primero tienes que recuperar el arranque de Windows, para ello necesitas el CD de Windows y había que hacer algo de fixmbr y poco más, busca "recuperar arranque Windows XP" y te saldrá, es un tema muy tratado.
Una vez hecho esto, te puedes cargar las particiones de Ubuntu tranquilamente. Te recomiendo gparted, que lo puedes encontrar en el cd de Ubuntu. Entras a Windows, desfragmentas, reinicias e inicias el ordenador desde el livecd de Ubuntu, abres gparted (me imagino que estará en Aplicaciones -> Herramientas del sistema), borras las particiones de Ubuntu y redimensionas la de Windows para que ocupe todo el disco. Recomendación, la de siempre, copia de seguridad de lo importante, nunca se sabe lo que puede pasar, no suele dar problemas pero nunca está de más.