No tiene nada que ver.
Puede que lo vea y que no lo vea. Sólo depende de su capacidad de estereometría.
A veces el ojo vago hace que se pierda esa capacidad. Pero si el ojo vago no es de nacimiento no tiene por qué. La estereometría es una forma que tiene el cerebro de captar la profundidad y se aprende desde el nacimiento. Cuando alguien nace con un ojo vago (o directamente sin capacidad estereométrica) aprende a ver por referencias en profundidad, aunque puede que a veces tenga problemas, pero tampoco es grave. Estos somos los que no podemos ver las 3D. Por lo demás, tengo amigos que incluso nacieron con ojo vago y ven 3D.
Es cuestión de probar. O de ir a un oftalmologo u oculista y que le haga la prueba de la estereometría.