Yo realmente si el disco duro lo ves muy chungo pasaria de el y compraria otro.
Si haces un Formateo Fisico del disco y "solucionas el problema" pero tiene sus riesgos, ya sabes que lo que arreglaste tiene muchos botelos de volverse a romper, y como se te habra instalado el SO en esos sectores antes defectuosos...
Yo probaria hacer primero un Formateo Logico (ya que dices que has recuperado la informacion), haber si con eso el Disco Funciona bien.
Si no pues eso, un formateo Fisico y a rezar.
Salu2