A mi siempre que se me ha quedado asi, pero ha reaccionado al cabo de 10 minutos largos, es porque encuentra una FAT32 que no le gusta demasiado, supongo que cosas del partition magic o algo asi.
Si no esta ni particionado, lo mismo tiene un error fisico. Además de que los disquets tambien pueden haberse estropeado. Supongo que los utilizas porque no tienes arranque desde Cd en ese pc, o por costumbre.