Has probado a cambiar la conexión por el simetrico? Es decir, si es el trasero izquierdo, intercambiar el cable de audio con el trasero derecho. Comprueba si lo que se sigue sin escuchar es el mismo altavoz (problema del altavoz o su cable) o bien la misma "posición", con lo que el problema estará en la tarjeta, el ampli, el deco o alguno de los cables que van entre esos elementos.
No obstante, si tuviera que jugarmela por algo, diría o que tienes un cable un poco suelto o que tienes un balance completamente a un lado, ya sea software (mira los controles de volumen de windows) o hardware (mira a ver tu ampli/deco -que puede ser la caja del subwoofer posiblemente- que puede tener control de balance)