Pues yo uso el TMPGenc, que antes era de pago y aora esta la version Free, que es gratis.Le das a MPGtools y luego Merge & Cut.
Si encuentras uno q sea de pago, puedes usarlo para cortar, pero busca un pco, q encuentras el Free.
Chao, y si tienes alguna duda, dimelo q te respondo sin problemas.