Si das mas datos... quizá pueda ayudar. No obstante, a ver si te sirve esto.
1º Cuando instalaste xp cambiaste la particion a NTFS? en caso afirmativo perderás todo porque el 98 no sabe que hacer con ese sistema de archivos.
2º Si instalaste xp encima de 98, lo que hayas instalado despues dejará de funcionar normalmente (mas que nada por el registro de windows y alguna que otra dll)
Saludos