Y al desconectar el disco siguen sin ir? A veces los usb se quedan sin potencia si tienen que alimentar dispositivos que piden mucho. La solución en esos casos es comprar un hub usb con alimentación propia, y conectar los dispositivos que tiran mucho de corriente al hub.
Pero si al desconectar el disco duro te siguen sin ir los usb... es mu raro. Se te pueden haber frito, supongo. Prueba a conectar el ratón a otros usb. Si estaba conectado a los de la placa base, prueba a conectarlo a los del frontal/tarjeta extra usb que suele venir con la placa. Esos van a un conector interno distinto (lo que no se es si luego internamente van al mismo bus usb).
Tb puedes forzar la desinstalación de los drivers usb, reiniciar el pc y que windows los reinstale.
Suerte!