Necesitarias un demonio o algo monitorizando la carpeta de "entrada" y dependiendo de ella los envié a una carpeta con los datos de fecha actuales y sino existe, que los cree.
Para evitar malgasto de recursos creo que lo suyo seria que comprobase 2 o 3 veces al día como mucho vamos procediendo al archivado de estos archivos que has enviado.
En resumen, el comando seria algo como.. comprueba si hay archivos, si los hay, coge mesdia actuales y los mete en una carpeta con ese nombre, sino existe, la crea.
Al comprobarlo cada dia no tendria que consultar fecha de creacion, modificacion ni nada mas complejo (que tambien se podria vamos).
Pero no se si la sintaxis de los script que usa ese servidor si tiene una propia sorry, pero por separado si es mas que posible y no creo que muy complejo ^^.
