Si la placa es de la época de la tos, puede ser cierto, que necesita ese pin.
La toma de 5V se hizo opcional en el estándard ATX 1.2, y retirada por completo en el 1.3. Actualmente vamos por la revisión 2.3, que data de 2008 si mal no recuerdo, así que salvo que hablemos de un equipo de 2000-2002 no va a ser de eso, tendrá la placa frita y listo. Además que si tiene un pc de la época probablemente a la fuente le falten conectores (y potencia en la linea de 3.3V)
Sobre cómo sacar los -5V... supongo que lo que dice el compañero es lógico, sacar -5V es tan sencillo como usar el cable de 5V y el de masa pero cambiados, pero vamos que no creo que vayan por ahí los tiros y me parece una chapuza.
Saludos