Hola, no te puedo dar respuesta avanzada, pero te diría que el primer cambio es la gráfica, con una Ati HD 7770 o una Geforce 460 vas a notar un cambio de gigante, (elegiría Ati), tambien creo que és importante añadir más memoria, cuatro Gb por ejemplo, es decir lo que se suele hacer en estos casos. Subir el procesador a 2,6 o 2,8 Ghz tambien ayudará a ganar rendimiento, pero seguramente será una mejora escasa, y sí elevará la temperatura, (no soy amigo del oc) tu placa utiliza socket 775, por lo que no és fácil plantearse sustituir el micro por uno mejor o mucho mejor, porque sería casi lo mismo que pagar por un overclocking que puedes hacer gratis, o invirtiendo 30 euros en un buen ventilador.
Cinco discos duros junto con los diferentes ventiladores del ordenador generan un ruido importante, podrías plantearte quitar cuatro discos y añadir uno de 2 Gb (están tirados ahora mismo), éste junto con uno de 500 anterior y el externo de 2 Gb ofrecen buena capacidad, tambien te puedes plantear un SSD, el problemilla es que 512 Gb cuestan casi 400€, y 256 Gb, 250 €.
La temperatura excesiva provoca cuelgues y ralentizaciones, a lo mejor el sistema sufre un recalentamiento, prueba a comprobarlo desde la Bios, (en el apartado 'PC Health Status'), vigila tambien el polvo que tenga acumulado la torre.
Saludos