Mala época para comprar discos duros ¿eh?
Si quieres un consejo, no compres ahora un disco duro. Y otro consejo, cuando lo compres, hazlo por separado. Disco por una parte, carcasa por otro. Te saldrá más barato y a tu gusto.
Con respecto a tus preguntas, el disco de 3,5 pulgadas es bastante más grande que el de 2,5. Para transportar mucho mejor este último, porque los de 3,5, tela jeje. Y con respecto al USB, aquí tienes:
http://es.wikipedia.org/wiki/USB_3.0En resumen, es la hostia de rápido
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y el 2.0 está desfasadísimo en los tiempos que estamos en los que se copian gigas y gigas a los pendrives.