Si usas w98 utiliza bittorrent, y si es posible el utorrent, es rápido, y muy ligero (menos de 4 mb en memoria, y unos 150kb el exe).
Asi no tendrás problemas por el rendimiento.
Pero si sigues quiendo usar el emule la única opción que funcione bien será linux + mldonkey como bien te han dicho y un linux muy ligero (si dominas un poco pon uno sin interfaz de usuario, el mldonkey una vez instalado puedes acceder a el desde el navegador de otro pc asi que no necesitas interfaz de usuario para nada). Sino tendrás que ponerle más ram para poder usar windows y el emule, que precisamente no es un programa que consuma pocos recursos (el solito ya se chupa los 32mb).