La H97-HD3 es tamano ATX , las otras dos son micro-atx.
De las dos microatx una es chip Z (Z97M-DS3H) y la otra H(H97M-D3H), la Z es para hacer OC cuando tienes un procesador K. La H seria version narmal.
segun el modelo de i5 que tengas y tu caja por tema de l epsacio, elige la mejor opcion.