Pues sacado de un artículo de todo linux (número 24) te enumero las que venían en la revista:
DOSEMU (para aplicaciones DOS)
WINE (de sobra conocido)
PLEX86 (FreeMWare)
BOCHS
Y nada más, la verdad es que el panorama libre a este respecto no es muy bueno que digamos, la mayoría son emuladores o máquinas menos eficientes en cuanto a velocidad que el VMWARE (esto lo pone en la revista, yo sólo he probado el wine y el vmware y la verda es que el vmware va muy bien y mucho más sencillo que el wine, aunque su finalidad es distinta).
Un saludo