Instalar software no anula la garantia, aunque sea el sistema operativo y tengas que formatear.
Tampoco la anula el que hayas hecho algo con el clip o las pinzas, solo que lo que hayais hecho logicamente no lo cubre lagarantia, Lo que si que la anula es si habeis abierto el aparato por ejemplo.
Me suena exagerado eso de 450 €, fijo que te cobrán tambien por reinstalarte el sistema y demás software y a saber por que más 8y mano de obra). Si te la suda la garantia pues prueba a llevarlo a una tienda que tengan servicio tecnico propio y que te fies. cambiar el lector no repercute en la placa en principio eso sí puede que con tanto lio hayas perdido las fotos si le ha pasado algo a la tarjeta :8
De todas formas me suena haber visto un problema así hace poco por el foro, mira en la busqueda a ver si encuentras el hilo y que solución le pudieron dar.
Suerte