Desinstálatelo otra vez, pero esta vez borrando todo lo que tenga que ver con eMule del registro. Luego te lo bajas de nuevo, te lo instalas, le pones los puertos de números altos altos que no sean ni capicúas ni con números repetidos, los abres en el router, en el firewall y pruebas otra vez. Si sigue sin funcionar puede ser un problema del hardware.