En principio en la mayoria de lectores de tarjetas integrados no tienes la opcion de extraer con seguridad de windows. Yo con mi lector de tarjetas integrado en la impresora lo que hago es irme a MIPC y en la unidad de la tarjeta normalmente creo que es G: o algo similar hago boton derecho sobre ella y le doy a expulsar, para comprobar que ya la ha expulsado lo que hago es doble click sobre la unidad y si me dice que inserte disco en la unidad es que ya esta cerrado con seguridad, a veces tarda un poco si hay datos intercambiandose y si no hay nada es instantaneo.
Un saludo