No se si te referiras a que el pc no te reconoce la unidad una vez formateada, o si es que en el hdl-dump no te aparece el listado de juegos instalados en ese HD.
En mi caso y si te sirve de ayuda, primero instale una version del hdl-dump, no recuerdo cual, en la que solamente te aparece la posibilidad de activar 3 modos, y en esa version no te da la opcion de ver el listado de juegos. Posteriormente instale creo que la 0.8... y en esta ultima, que ademas de aparecer el listado de los juegos marcando una casilla, en otra es INSTALL GAMES, pues en esta version tb te aparecen muchos mas modos.
Directamente arriba se marca la casilla de HD conection o algo asi, o HD2... y no debo hacer nada mas, pero eso si, el pc no reconoce este disco duro, solamente el HDL_DUMP...
Bueno estos comentarios por si te son de ayuda.
De todas formas hay por ahi un tutorial que quizas te aclare todas las dudas
http://www.elotrolado.net/showthread.php?s=&threadid=318585
Saludos.