El Vsync solo puede funcionar en una pantalla. Es posible que tengas como primaria la que no estés usando para jugar. Si usas AMD, en el Catalyst ve a "administración de escritorio"- "creación y organización de escritorios" y abajo te saldrán las pantallas, das al triangulo negro de la que quieras y elige "hacer preferido". Esa será la primaria y sobre la que actuará el Vsync.
Si tienes Nvidia ni idea.