a mi también me pasa a veces eso, muy de vez en cuando pero me pasa, y dudo mucho que sea de la grafica y del monitor, me fijé que solo me pasaba cuando abria ciertas paginas, me iba mal el scroll y el puntero del raton me hacia como parpadeos, lo descubrí cuando teniendo varias pestañas a la vez, iba cerrandolas de una a una, cuando cerraba alguna en concreto las demas me volvian a ir bien, fluido y sin parpadeos de puntero de raton, prueba a ver, sino quizá pueda ser problema de plugins o algo por el estilo.
suerte