Hola, seguramente voy a decir una chorrada, pero a raiz del comentario de que te es imposible jugar aunque se trate de un juego con tres años, nos planteamos que tu ordenador dependerá en gran medida de los dispositivos integrados en placa, (red, video, sonido), los tres integrados 'chupan' poder al procesador principal para poder gestionar sus funciones, eso podría estar ralentizando odo el sistema, aunque es dificil que un I5 usando Linux sufra por estar manteniendo los tres dispositivos, por otro lado se descarta un posible virus, porque los virus de Ubuntu nada tienen que ver con los de Windows y de haberlos, el s.o ya te hubiera avisado. ¿Pòdrías probar el ratón en otro PC o portátil?.
Otra prueba es usar un Live CD de Linux, ahí es más dificil que el puntero se ralentice.
Saludos