Os comentó el problema que me ha surgido a ver qué solución me podéis dar:
Resulta que quiero instalar Ubuntu 12.04 junto con el Windows 7 así que hago las particiones todo bien y en la opción “dispositivo donde instalar el cargador de arranque" le pongo donde la raíz ya que según tengo entendió poniéndolo ahí si formateamos Windows no nos lo cargaríamos así que acaba la instalación y veo que entra Windows hasta ahí todo bien, el fallo viene cuando decido poner el gestor de arranque GAG lo instalo lo configuro y cuando voy a grabar en disco me salta un error diciendo que no lo graba, a partir de ese momento ya no me deja entrar en Windows al final lo he solucionado pero ni idea de cómo lo he hecho. ¿Alguna solución para lo del GAG???