Preguntas:
- El es disco donde está instalado el Windows?
- Si tú pones ese otro disco y dejas el disco con problemas como slave, tienes como acceder a los datos en ese disco?
Si la respuesta a las dos preguntas es "sí", es la instalación de Windows que tiene problemas. Haz backup de los datos instalando el otro disco para acceder a los datos del disco "con problemas". Después, sólo hay que volver a la instalación anterior, formatearlo e instalar el Windows otra vez.