Mientras te responde alguien con más info, yo recuerdo que hice algo parecido hace tiempo, y si me dejó.
Mira a ver si el cue y el mp3 tienen el mismo nombre, prueba a ponerle el mismo nombre... es un poco chapuza, pero a veces sale.
En princpio sirve para partir el mp3 en pistas... pero si no te va, puedes partirlo tú mismo a mano.