Suele ocurrir ya que una es la salida primaria y otra la secundaria, cuando entras al sistema operativo desde el panel de control de la tarjeta de video puedes cambiar esto.
Para probar si funcionan o no, ya en windows apaga el monitor y cambia de puerto de salida de la tarjeta de video el cable de video, prendes el monitor y debe detectar la señal de video. Tambien rvisa en las opciones del moniotor si tienes alguna configuracion de preferencvia de entrada o si esta todo el AUTO.