No va a sonar igual porque por cable digital (optico) el que procesa el sonido es el decodificador de los Sharkoon, la Ps3 lo que hará es pasarle el sonido sin tocar, lo mismo si lo haces en el PC. En cambio con un cable analogico, la Ps3 y la tarjeta de sonido tendrán que procesar el sonido, y como tendrán chips de calidad baja, pues sonará peor. Evidentemente si compraras una tarjeta de sonido buena, entonces sería más recomendable conectarlo con cable analógico para poder aprovecharla, ya que debería tener más calidad que el chip del deco de los Sharkoon.
Como han dicho, si quieres tener 5.1 real en juegos usando conexiones digitales (optico), deberás activar la opción de Dolby Digital Live o DTS-Connect en el menú de tu tarjeta de sonido, aunque sea integrada es posible que lo tenga, he visto varias Realtek que lo hacen, deberías ponerte los últimos drivers y software y mirarlo.