Creo que se lo que te pasa
Tu has echo una copia de seguridad de tu juego Original, y claro como tal has instalado un parche NO-CD para asi no tener que tener metido el disco en la unidad lectora
por eso al aplicar el parche te dice que los archivos no coinciden, lo que debes hacer para asegurarte al 100% que te funciona es hacer lo siguiente
Desinstala la versión que tengas en el PC, vuelve a hacer un backup de tu juego, esta vez no le apliques ningún Crack, ahora instala la actualización, y a continuación instala el NO-CD que corresponda con la versión del Juego, en este caso la 1.1
PD: También puedes probar directamente a bajar el NO-CD que corresponde con la versión, sin desinstalar
PD: Si la versión que has usado desde el principio es la original sin aplicarle un NO-CD, entonces esto no te ayudara

Tienes un MP, con ayuda sobre el Crack NO-CD