He estado buscando si alguien ha tenido mi problema anteriormente y me encontrado con esto:
http://www.elotrolado.net/showthread.php?s=&threadid=785290&highlight=apagar+pc
He hecho lo que se comenta en el post y no consigo que que apague bien.
Bueno los acpi-modules, no los he instalado simplemente porque no los encuentro y en la pagina que dais, no estan los modulos de mi kernel.
He probado añadir esto en menu.lst:
kernel /vmlinuz-2.6.18-5-686 root=/dev/hda2 ro acpi=force_lapic
Pero me sigo con el mismo error.