Respuesta tonta: la marca
Cachondeo de lado, no hay diferencia alguna si no te encuentras con versiones OC o con disipadores distintos del estandard. Si visualmente las ves iguales y no se especifica que tengan overclock de fábrica, son las misma con distintas pegatinas.
El hecho de que la monte uno u otro hace que varien de precio ya por políticas de empresa o por calidad del ensamblado. Por ejmplo en ATI Saphire es de lo mejorcito.
Saludos