Hola
Yo tengo tambien unas dudas con este tema.
Al final lo que me parecio mas correcto (teniendo en cuenta que no tengo ventiladores en la parte superior y si en la trasera) fue colocarlo lateralmente. Es decir el disipador en vez de estar "horizontal" como el tuyo, yo lo puse "vertical" de modo que chupa aire de la parte "delantera" y lo expulsa hacia atras que es donde esta el extractor posterior de la caja.
Lo hice asi porque suponia que crearia una "corriente" mas fuerte. No se si es una burrada. Es que si lo ponia como tu, el ventilador-extractor trasero de la caja no valia para nada ya que quedaba por debajo de donde expulsaba el aire el disipador del micro (como se ve en tu primera foto).
Si alguien me puede dar su opinion se lo agradeceria.
Un saludo