Buenas, en estos casos se recomienda desfragmentar el disco duro (reorganizarlo) para así ganar velocidad al estar el disco más ordenado. Puedes hacerlo con
Defraggler.
Luego, hay una serie de malware que con frecuencia no es detectado por los antivurus (spybots) y aunque muchos son semi benignos, ralentizan mucho el sistema operativo, más que los virus comunes, puedes utilizar
Hijackthis y S&D Spybot para localizarlos.
Un tercer factor; la temperatura del procesador, tal vez está siendo más alta de lo normal por acumulación de polvo en los ventiladores y esto hace que el ordenador baje su rendimiento para no seguir calentándose. Con
CPU-Z es posible monitorizar la temperatura, en función del procesador de tu equipo está será más baja o alta. Hay tutoriales para abrir el equipo y limpiar los ventiladores.
Saludos