El pagefile.sys es la memoria fisica que se usa en alternativa a la RAM, a no ser que tengas mucha RAM como para que nunca te falte en el uso que le des, no lo elimines. Este archivo seguramente ha permanecido constante, solo aumentaría si te ha faltado mucha RAM para algo.
El archivo de hibernacion, si no hibernas, pues desactiva la hibernacion y luego mira ver si ha eliminado el archivo, sino, lo eliminas a mano.
Los otros que dices, son carpetas que contienen cosas de programas.
Lo que es posible que te haga variar el espacio, es la restauración del sistema, quizas la creación de nuevos puntos de restauración, y eliminación de viejos. Esto sumado a los temporales, archivos de prefech, quizas desinstaladores de las actualizaciones de windows, pues hace variar el espacio, tambien ten en cuenta que el escritorio esta en el HDD principal, por si descomprimes o descargas algo en el.