Es posible que sea por tenerlos en el HDD, sí. Prueba a ponerlos en el SSD y/o comprobar si en los del SSD te salen.
También me aseguraría de hacer una instalación correcta de drivers (si no la tienes). Para ello usa el programa DDU para desinstalar los drivers actuales y luego instalas los descargados de la web de Nvidia.
La fuente, como te han comentado, está enfocada a equipos que usen pocos recursos, pero, en principio, no debería de serla causante de los tirones ya que causaría otros (como BSOD o Blue Screen Of Death, el pantallazo azul de la muerte de toda la vida, vaya; reinicios, etc).
