Pues leyendo el post que mencionas, yo deduzco que lo único que cambiaría sería las IDs de los saves:
WIISAVES/RSBE a WIISAVES/RSBJ, para convertir de USA a JAP.
Además de editar el programa de el torito21 para cambiar el crc32, lo cual no sería difícil pues incluye las fuentes.
Ya con la información que viene al final (Bonus Track) sobre el CRC32 y teniendo ambas partidas (una USA y una JAP) no creo que sea muy difícil averiguar el CRC32 y hacer las modificaciones pertinentes.