Fat32 peta al pasar de 4gb un archivo, no soporta más, muchas veces lo dar como un error de falta de espacio o como error a secas. O formateas el pendrive en NTFS de Windows, o algún formato de Linux.
Mientras esté en Fat32 no hay nada que hacer. En Windows con el pendrive en Fat32 estarías igual con el mismo problema.
