Con respecto al raid, te ira bien aunque lo configures haciendo el pino jeje, el rendimiento de 2 raptor en raid es espectacular. Ten en cuenta que, aunque tengas 2 discos, el raid hace que funcionen como uno solo, con lo que el rendimiento de las aplicaciones no mejorará aunque las instales en otra particion.
Se suelen instalar las aplicaciones en un disco y el sistema en otro, cuando los discos estan separados y funcionando asincronamente, y no unidos por un raid.
Con respecto a la grafica, si es normal que acumule tanto calor. Por muy bueno que sea el disipador (que lo es), 80 grados es normal en una tarjeta de gama alta con refrigeracion pasiva. Cuando le instales el ventilador, notaras la diferencia, x muy despacio que gire.