Para ayudarte con ello necesitamos saber algunas cosas:
¿Qué placa base tienes? (Hay placas base que tienen una limitación para no poderse poner discos duros de más de 32 gigas, si estás intentando instalar Windows 98 en esa máquina, por el tiempo que tenga tendrás muchas papeletas a que te pase lo mismo)
¿Qué disco duro has comprado? (Tamaño, marca, modelo...)
¿Te has acordado de configurarle bien los Jumpers de maestro / esclavo?
¿Te sale el disco duro reconocido en el POST de la máquina? (POST = Mensajes que salen en el arranque del ordenador, cuando cuenta la ram y te dice que discos duros / unidades de CD hay en el ordenador, salen nada más encenderse y antes de que salga la imagen de Windows 98)