Tienes hecho OC o tienes todos los voltajes en sus valores de fábrica. La mayoría de gente que veo que tiene problemas parecidos, desconexiones de discos, puertos USB, etc... suelen ser gente que le hace OC, que al suspender o hibernar sus equipos tienen problemas parecidos al tuyo.
Prueba haciendo un Clear CMOS para devolver los valores de fábrica, a ver si así ya no tienes esos problemas, ah, y algo muy importante también es tener una fuente relativamente moderna, muchas fuentes algo antiguas no aguantan bien los valores de voltaje en modos de bajo consumo.
Si no es nada de eso, pues no sé decirte la verdad.
Saludos.